據市港口局最新統計，2013年南通港共完成貨物吞吐量2.05億噸，比上年增長10.6%，成為省內第2個突破2億噸的港口。去年，南通港集裝箱運輸也表現不凡，累計吞吐60.05萬標箱，比上年增長19.1%，首破60萬標箱大關。以上指標不僅創下南通港歷史新高，而且增長幅度領跑全國規模以上港口。

從貨種情況來看，金屬礦石、煤炭、礦建材料是三大主力，吞吐量占全港七成以上。 2013年，南通港金屬礦石共完成5873.7萬噸，比上年增長11.5%；煤炭完成5242.4萬噸，比上年增長17.2%；礦建材料完成3387.8萬噸，比上年增長5.2%。

據業內人士分析，在外部經濟形勢較為嚴峻的情況下，南通港口生產之所以保持較快增長，主要得益于近年來該市港口建設加速推進，沿江海油碧路、南通電廠、寶鋼物流等碼頭建成投產，港口通過能力不斷增加，加上該市沿江港口企業通過碼頭結構加固改造，碼頭靠泊等級明顯提升，大船品牌優勢進一步得到發揮，全年共接卸15萬噸級以上大型船舶201條。同時，隨著南通市沿海開發的深入推進，沿海港口生產規模逐步擴大，全年共完成吞吐量2034萬噸，其中洋口港區10萬噸級LNG碼頭共接卸LNG船舶30艘，大多為全球最大的Q-Max船型。